实验室培养的癌细胞与人类的癌细胞有很大不同
(Yothin Sanchai/EyeEm/Getty Images)
在推动更好发展的同时癌症治疗并努力寻找一种潜在的方法来治愈这种潜在的疾病,在培养皿中生长的细胞至关重要,但新的研究强调了这些细胞与人体内生长的癌细胞之间的一些关键遗传差异。
虽然这并不意味着使用实验室培养的细胞进行的实验室研究没有用处和信息丰富,但对于科学家来说,在寻找阻止肿瘤扩散和造成损害的方法时,了解这些差异是什么很重要。
研究人员开发了一种名为 CancerCellNet (CCN) 的模型,用于将体内的癌细胞与其他四个来源的癌细胞进行比较:26 个经过改造的小鼠模型,以产生癌症; 415 只小鼠移植了人类癌细胞(异种移植物); 131 个在实验室中生长的 3D 组织球,用于模拟肿瘤(类瘤);和 657 种传统癌细胞系(培养皿中生长的癌细胞)。
通过比较核糖核酸通过这些细胞的序列——决定蛋白质如何发育的生物指令——对照癌症基因组数据库,研究小组能够计算出它们在基因水平上与体内癌症的相似程度。
“对于科学家来说,癌细胞系在遗传上不如其他模型可能并不奇怪,但我们惊讶的是,相比之下,基因工程小鼠和肿瘤样细胞表现得非常好,”分子生物学家和遗传学家帕特里克·卡汉说来自约翰·霍普金斯大学。
平均而言,在大约 80% 的测试肿瘤类型(包括乳腺癌、肺癌和卵巢癌)中,基因工程小鼠和类肿瘤的 RNA 序列与实际人类癌症最接近。
癌细胞系的表现就没那么好,与有记录的人类肿瘤存在更多差异。在研究中提到的一个例子中,一种名为 PC3 的前列腺癌细胞系实际上更类似于膀胱癌。似乎细胞系一旦离开自然环境就开始发生变化。
“RNA 是细胞类型和细胞身份的一个很好的替代品,这是确定实验室开发的细胞是否与人类细胞相似的关键,”卡汉说。
“RNA 表达数据非常标准化,可供研究人员使用,并且较少受到可能混淆研究结果的技术变化的影响。”
CancerCellNet 的优点在于它的多功能性和快速性:它肯定比将癌症移植到小鼠体内以观察它们如何发展更快、更便宜,这是科学家目前用来比较不同模型的方法之一。
需要牢记这项研究的局限性。尽管 RNA 是一种很好的细胞比较方法,但它并不能说明全部情况,研究人员希望向他们的 CCN 训练数据库添加更多数据,以使其更加准确。
此外,值得注意的是,该研究还研究了相对较少的工程小鼠模型和肿瘤样物质,这可能在一定程度上扭曲了结果。
虽然这只是 CCN 的开始,但它显示出很大的前景,能够帮助研究人员了解他们的癌症模型的真实性和可靠性基于他们的研究将它们转化为实际的治疗方法。更重要的是,它也可以轻松适应未来的癌症模型。
研究人员在他们的论文中解释道:“由于 CCN 是开源且易于使用的,因此它可以轻松应用于新生成的癌症模型,作为评估其保真度的手段。”纸。
该研究发表于基因组医学。