卡内基·梅隆大学（Carnegie Mellon University）的研究人员开发了一种新方法，用于确定基因组的一部分，这对于了解物种的物种特征如何发展至关重要。
在计算机科学学院的助理教授安德烈亚斯·普芬宁（Andreas Pfenning）的领导下，动物动物学项目旨在对240个哺乳动物的整个基因组进行测序。
这项努力的目的是阐明基因和特征的基本特征，这些特征在保护人类健康和维护物种的多样性方面具有重要意义。
隐性
为了更好地了解基因组功能的增强剂区域，研究小组开发了一个机器学习方法称为组织感知的保护推理工具包（TACIT）。
非编码DNA区域的增强子控制特定基因的激活，在物种的进化中起着至关重要的作用。由于增强剂解释了基因组的很大一部分，因此他们的研究对于理解进化至关重要。
“ Tacit提供了一个前所未有的机会，可以预测物种中基因之外的基因组部分的功能，我们无法获得原代组织样品，”说纸上的首席作家艾琳·卡普洛（Irene Kaplow）是CBD的博士后同事和巷道研究员。
“随着用于识别特定细胞类型的增强子的ML方法和方法，我预计我们将能够扩大TACIT的功能，从而为哺乳动物进化提供新的见解。”
240个哺乳动物的基因组序列
研究小组使用TACIT来预测240个哺乳动物中基因组序列的功能，然后将其应用于检测这些动物中大脑已进化的基因组区域。他们的发现表明，这些区域通常位于已知与人类大脑大小有关的基因附近。
此外，该小组确定了与哺乳动物中社会行为相关的增强剂，该增强剂特定于一种称为白蛋白阳性抑制性抑制性的神经元类型。
该研究的高级作者安德烈亚斯·普芬宁（Andreas Pfenning）说：“我们认为这只是冰山一角。”
“我们通过将默示应用于少数组织和少数特征，发现了有趣的关系，但还有更多的发现。”
在使用机器学习来识别增强子区域的这种突破对保护生物学具有重要意义，因为它允许科学家对增强剂在无法受控的实验室实验的濒危或威胁物种中的功能进行预测。
通过确定基因组的哪些部分已经发展为某些特征，科学家可以更好地了解物种如何随着时间的流逝而适应并制定保护生物多样性的新策略。
团队的发现是出版在《科学杂志》中。
