ทีมนักวิจัยจากซีซีโรได้ถอดรหัสจีโนมของปลาแฮนด์ฟิชด่าง (Brachionichthys มีขนดก-ซึ่งเป็นปลาทะเลที่ใกล้สูญพันธุ์อย่างยิ่งเฉพาะถิ่นของแทสเมเนีย
ปลาแฮนด์ฟิชลายจุด (Brachionichthys มีขนดก- เครดิตภาพ: CSIRO
Brachionichthys มีขนดกเป็นปลาหน้าดินพันธุ์หายากในวงศ์ปลามือBrachionichthyidae-
ปลาแปลกชนิดนี้อาศัยอยู่เฉพาะบริเวณปากแม่น้ำเดอร์เวนท์ แทสเมเนีย และพื้นที่ใกล้เคียงเท่านั้น มักพบที่ระดับความลึก 5 ถึง 10 เมตร (16-33 ฟุต)
อธิบายอย่างเป็นทางการครั้งแรกในปี 1804,Brachionichthys มีขนดก มีครีบอกที่ดัดแปลงมาอย่างดีมีลักษณะเหมือนมือและปล่อยให้เดินบนพื้นทะเลได้
สายพันธุ์? อาหารได้แก่ หอยขนาดเล็ก กุ้ง และหนอนโพลีคีเอต
Brachionichthys มีขนดกเป็นจำแนกเช่นใกล้สูญพันธุ์อย่างยิ่งอยู่ในบัญชีแดงของ IUCN 2020; นักวิทยาศาสตร์ประเมินว่ามีคนน้อยกว่า 2,000 คนที่ยังคงอยู่ในป่า
การลดลงอย่างรวดเร็วมีสาเหตุมาจากการประมงในอดีต การพัฒนาชายฝั่ง การเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ และการมาถึงของสายพันธุ์ที่รุกราน
?ลำดับจีโนมจะช่วยเพิ่มความพยายามอย่างต่อเนื่องในการเพิ่มจำนวนประชากรและติดตามความหลากหลายทางพันธุกรรม Gunjan Pandey นักวิจัยของ CSIRO กล่าว
?จีโนมช่วยให้เราเข้าใจว่าสิ่งมีชีวิตทำงานอย่างไร?
?เป็นรากฐานสำหรับการทำความเข้าใจการแสดงออกของยีนในชีวิตประจำวัน และให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับประวัติวิวัฒนาการของมัน?
?ด้วยจีโนม เราสามารถช่วยในการตรวจจับชนิดพันธุ์ ติดตามจำนวนประชากร และแม้กระทั่งประมาณอายุขัยของปลาได้?
ข้อมูลทางพันธุกรรมอันอุดมสมบูรณ์นี้จะช่วยแจ้งยุทธศาสตร์การอนุรักษ์ในระยะยาว? คาร์ลี เดวีน นักวิจัยของ CSIRO กล่าวเสริม
?มาตรการอนุรักษ์กำลังขยายครอบคลุมถึงพันธุศาสตร์ โดยการยอมรับแนวทางแบบสหสาขาวิชาชีพควบคู่ไปกับการวิจัยด้านนิเวศวิทยาถือเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการอนุรักษ์สายพันธุ์ที่ถูกคุกคามอย่างมีประสิทธิภาพ?
?สัตว์ทะเลอย่างปลามือลายจุดนั้นเลี้ยงยากอย่างฉาวโฉ่?
?DNA ย่อยสลายอย่างรวดเร็วและปนเปื้อนไปด้วยจุลินทรีย์?
?สิ่งนี้ทำให้การประกอบจีโนมบริสุทธิ์มีความท้าทายอย่างยิ่ง?
ทีมงานสามารถจัดลำดับจีโนมที่สมบูรณ์จาก DNA ที่มีคุณภาพต่ำจำนวนเล็กน้อยได้ โดยใช้สิ่งที่เรียกว่าโปรโตคอลอินพุตต่ำ
?เราเป็นหนึ่งในสามทีมทั่วโลกที่ใช้โปรโตคอลนี้? ดร.ปานดี กล่าวว่า
?เราปรับแต่งกระบวนการทั้งหมด ตั้งแต่การตั้งค่าห้องปฏิบัติการไปจนถึงซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศ เพื่อจัดลำดับจีโนมคุณภาพสูงจาก DNA ที่มีคุณภาพต่ำ
อะไรเคยใช้เวลาหกถึงสิบสองเดือน ตอนนี้เราทำสำเร็จได้ภายในไม่กี่วัน เทคโนโลยีนี้ถือเป็นคำมั่นสัญญาที่ยิ่งใหญ่สำหรับความเข้าใจและการอนุรักษ์สัตว์ใกล้สูญพันธุ์ทั่วทั้งออสเตรเลียและทั่วโลก?
