由约翰·英尼斯中心科学家领导的研究小组对染色体规模的基因组组装进行了测序和注释草豌豆(山黧豆),一种很有前景的豆科作物,能够耐受多种胁迫因素,并具有适应气候变化的农业潜力。
草豌豆是一种豆科作物,因其面对干旱、洪水和盐分等环境压力的恢复能力而受到重视。
这种作物的种植历史至少有 8000 年,分布广泛尽管目前大多数种植发生在南亚以及埃塞俄比亚和厄立特里亚的高地,但欧洲、亚洲和非洲部分地区都有种植。
草豌豆的广泛种植因其种子和芽中含有的毒素而受到阻碍,这种毒素可能在营养不良的人群中引起神经黧豆症,这种疾病会导致不可逆转的瘫痪。
阻碍作物育种改进的另一个主要障碍是缺乏作物的基因组参考。
新基因组序列的可用性意味着研究人员可以使用基因编辑和现代育种方法来开发具有改良农艺特性或低或零毒素含量的草豌豆品种。
这意味着草豌豆有望在未来为更加多样化和适应气候变化的粮食系统做出重要贡献。
“我们希望建立这个新的基因组序列作为草豌豆群落的参考基因组,我们很高兴与其他科学家分享这一宝贵的资源,以使用和了解草豌豆,”诺维奇可持续发展研究所和约翰·英尼斯中心。
“在天气冲击日益加剧的时期,这个基因组使我们能够解开草豌豆恢复力的秘密,进一步为农民改良这种作物,并为豌豆等其他作物的发展提供信息。”
草豌豆基因组序列的大小几乎是人类基因组的两倍,是从头开始组装的,并改进了早期草豌豆品系 LS007 的组装草案。
“当我们为气候变化加剧的未来做准备时,我们将需要能够应对干旱、洪水或咸水淹没的作物,”约翰·英尼斯中心的研究员安妮·爱德华兹博士说。
“这个新的基因组序列意味着我们更接近将草豌豆添加到明天的气候智能型作物名单中。”
“这是草豌豆研究界的一个激动人心的时刻。”
这发现发表在杂志上科学数据。
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M·维古鲁等人。 2024. 草豆染色体规模参考基因组(山黧豆)。科学数据11、1035; doi:10.1038/s41597-024-03868-y