
自SARS-COV-2出现以来新冠病毒这导致了共同的19,病原体已引起一系列后代。
通过在其遗传密码中拾取突变,其中一些后代(称为冠状病毒变体)具有更容易在人之间传播,超越免疫系统或触发更严重疾病的能力。这些能力使变体比其亲戚具有竞争优势,并且随着时间的流逝,优势的变体胜过宿主的弱势群体,并最终驱使他们灭绝。
Omicron变体首次出现在2021年11月并于2022年3月获得了全球知名度。截至2023年8月,Omicron的直接后代(称为Omicron Subvariants)只有彼此彼此与其他版本的冠状病毒的竞争相互竞争。
这世界卫生组织(WHO)排名在三类中循环SARS-COV-2变体:关注(VOC),感兴趣的变体(VOI)和监视下的变体(VUM)。截至2023年3月15日,没有循环的VOC,所有的VOIS和VUMS都是Omicron的不同子变量。
以下是SARS-COV-2变体的科学,包括Omicron和过去因突出的变体。
目前循环变体
Omicron变体(B.1.1.529)
变体出现在哪里?Omicron的原始版本(正式称为B.1.1.529)于2021年11月在南非首次确定。该版本于2021年11月26日将Omicron标记为关注的变体,但此后已被降级。
现在在哪里?Omicron迅速遍及世界各地,导致2021年12月和2022年1月的Covid-19案件激增。到3月中旬,Omicron是世界上主要的冠状病毒变体,占全球数据库Gisaid最近Covid 19病例的冠状病毒基因组序列的99.9%。
什么是关键突变?Omicron的原始版本有基因中有30多个突变该代码为其尖峰蛋白,其中10个基因编码为“受体结合结构域”的一部分,或锁定在人类细胞上的尖峰蛋白的一部分。
Omicron的其他一些突变也出现在先前关注的变体中。例如,Omicron具有N501Y突变,该突变也可以在Alpha变体中发现,并且被认为使病毒更具传染性,根据《纽约时报》。
最初的Omicron B.1.1.529从那以后从流通中掉下来,但在产卵数十个后代之前就没有。这些后代中的每一个都有其自身的遗传怪癖。
截至八月,谁的vois清单包括XBB.1.5和XBB.1.16,两个分支源自Omicron的XBB谱系。大多数VUM也是XBB子变量,除了BA.2.75及其后代Ch.1.1。
为什么有关变体?Omicron在峰值蛋白中具有许多突变,似乎使其更可传播,并至少部分逃避疫苗。一些研究估计,Omicron的BA.1子变量的传输是Delta变体的四倍,即根据CNBC。 BA.2仍然具有传染性 - 估计是可传输的1.5倍,是BA.1的1.5倍,CNBC报道。
疫苗有效吗?大多数COVID-19疫苗(包括美国使用的疫苗)启用了针对尖峰蛋白的免疫系统。由于Omicron在其峰值蛋白上具有的突变数量很高,科学家们期望与以前的变体相比,针对Omicron的疫苗对Omicron的有效性较低。
实际上,与早期变体相比,Omicron的突破性感染数量增加了。一项研究于三月发表的研究新英格兰医学杂志发现两剂辉瑞疫苗的疫苗有效性为65%,但疫苗接种后25周降至9%。但是,随着额外的疫苗剂量,射击的有效性上升到67%,然后在大约10周后下降到约45%。一个CDC报告于2022年1月发布还发现,额外的剂量为使用Omicron的住院提供了90%的保护。
在2022年秋季两次更新的Covid-19疫苗已发布它针对Omicron子变量BA.4和BA.5,以及SARS-COV-2的原始版本。当时,Omicron的这两种口味负责2023年美国的大多数新Covid-19案件,疫苗将再次更新,这次防止Omicron的XBB血统,其成员目前正在造成大多数案件。
(这XBB血统包括Eg.5,它于2023年7月下旬开始在美国统治。)
以前循环变体
以下信息最后一次更新于2022年3月。本文的先前部分于2023年8月更新。
增量变体(B.1.617.2)
变体出现在哪里?Delta变体(以前称为B.1.617.2)于2020年10月在印度首次确定,并于2021年5月被标记为关注的变体据WHO称。
现在在哪里?根据耶鲁医学的数据,根据耶鲁医学的数据,三角洲迅速成为美国的主要变体,并于2021年夏季在全球范围内成为全球,但在2021年12月中旬,它将在很大程度上被Omicron取代。除了Omicron外,Delta仍然是唯一具有显着全球发行水平的其他VOC。到3月中旬2022年中期,三角洲占全球数据库中最近COVID-19病例的冠状病毒基因组序列的0.1%。
什么是关键突变?Delta变体在峰值蛋白中具有几个重要突变,包括T19R,DEL157/158,L452R,T478K,D614G,P681R,D950N突变,根据爆发。其中两个突变-L452R和D614G - 使变体可以更牢固地固定在ACE2受体上,现场科学先前报道。其他人,例如P681R,可能会使三角洲逃避宿主的免疫力。
为什么有关变体?Delta变体的传播可能比Alpha变体高出60%,并且可能是在Wuhan中出现的冠状病毒原始菌株的传播的两倍。中国。此外,一些证据表明,这种变体比冠状病毒的早期变体更容易逃避现有的疫苗。
疫苗有效吗?美国批准的所有疫苗都可能针对三角洲变体工作,尽管尚不清楚。例如,英国公共卫生据《纽约时报》报道,发现辉瑞疫苗对三角洲的疫苗有效88%,而以色列的卫生官员宣布,辉瑞疫苗对三角洲的有效性仅为64%。但是,以色列并没有控制疫苗接种和没有接种疫苗的人的差异,使其数据难以解释,根据《纽约时报》。辉瑞疫苗对严重疾病和住院的强烈保护。在声明中,Moderna表示,它的疫苗中和Delta变体,尽管尚未提供有关感染的现实数据,但它可能与辉瑞mRNA疫苗相似。约翰逊和约翰逊说,他们的疫苗对三角洲变体产生了强烈的中和抗体反应,但没有报告降低有症状性疾病几率的程度,现场科学先前报道。
Alpha变体(B.1.1.7)
变体出现在哪里?根据世卫组织(WHO)的说法,Alpha变种于2020年9月在英国首次出现。到2020年12月,该变体已经出现在美国。
现在在哪里?Alpha在世界范围内几乎是灭绝的。根据英国的出现后,Alpha的变体很快在世界各地蔓延,并于2021年春季成为美国的主要变体。《纽约时报》。但是,《泰晤士报》报道说,但三角洲的变体取代了alpha,作为2021年夏季美国的主要菌株。此后,Alpha变体的案例在美国和全球范围内消失了。据世卫组织称,到2022年3月,在全球范围内,很少有来自Alpha的遗传序列,并且该变体被指定为“以前循环的VOC”。
什么是关键突变?根据该病毒菌株的原始菌株相比,α变体具有23个突变,其中有8个在病毒的峰值蛋白中。美国微生物学会。 (ASM)认为三个尖峰蛋白突变被认为是对病毒生物学的最大影响的原因:N501Y突变似乎增强了尖峰蛋白附着在ACE2受体上的紧密程度,这是对人类细胞的主要入口点;一些科学家说,69-70DEL突变可以与N501Y一致解释这种变体的可传播性提高。根据ASM的说法,p681h突变也可能提高传播性,因为它可能与病毒如何与人类细胞的膜融合以将其基因组融合到细胞中。
为什么有关变体?该菌株比新型冠状病毒的原始形式多50%,根据疾病控制与预防中心(CDC)。
疫苗有效吗?迄今为止的研究表明,两种mRNA Covid-19-19疫苗(辉瑞疫苗和现代疫苗)有效地防止了冠状病毒α变体的症状感染。例如,一项于2021年6月28日发表的研究自然通讯发现已经用辉瑞射击接种疫苗的医疗保健工作者的血液有效地中和B.1.1.7。一剂Johnson&Johnson疫苗还刺激了预防α变体的中和抗体J&J报告2021年7月。
beta变体(B.1.351)
变体出现在哪里?Beta版本以前称为B.1.351,于2020年10月在南非首次被发现,并于2020年12月被指定为关注的变体据WHO称。
现在在哪里?Beta也几乎灭绝了。它于2020年底和2021年初在南非迅速起飞,并蔓延到30多个国家,现场科学先前报道。但是在美国,beta从来都不常见,后来在曾经占主导地位的地方被三角洲所取代。自然新闻。根据世卫组织的说法。
什么是关键突变?Beta变体具有八个不同的突变,可能会影响病毒与细胞结合的方式,现场科学先前报道。最著名的是N501Y,K417N和E484K。 N501Y突变也可以在α变体中看到,可以使新型冠状病毒更紧密地与ACE2受体结合。 K417N突变可能会改变峰值蛋白的形状,从而使早期菌株的抗体不太可能识别峰值。第三个值得注意的突变E484K似乎也有助于病毒逃避抗体免疫系统根据2021年2月的研究英国医学杂志。
为什么有关变体?Beta变体比在Wuhan中出现的SARS-COV-2的原始菌株可传播约50%。据CDC称。疾病预防控制中心称,某些单克隆抗体对菌株的作用不太好。疫苗针对变体的有效性也较小。根据2021年7月的一项研究柳叶刀全球健康。
疫苗有效吗?大多数疫苗对β的功效低于早期菌株的功效。例如,根据2021年5月的一项研究新英格兰医学杂志。 Johnson&Johnson和Novavax疫苗对Beta变体的疗效也较低。当Beta是主要的菌株时根据全球病毒网络。关于现代射击对抗Beta版本的数据的数据有限,但大多数专家都怀疑它的工作原理与辉瑞的mRNA疫苗一样。
伽玛变体(第1页)
变体出现在哪里?2020年11月在巴西收集了最早的伽玛变体样本,也称为第1页据WHO称。科学家在2021年1月初首先发现了日本的变体,当时四名旅行者在前往巴西之旅后对该病毒呈阳性。然后,研究人员发现证据表明该变体在南美国家已经广泛存在,《纽约时报》报道。伽马于2021年1月11日被标记为关注的变体。
它在哪里?伽玛不再广泛循环。根据2021年7月,在全球74个国家 /地区报告了伽马。联合国。但是,根据世卫组织(Who Who)的数据,到2022年3月,伽玛(Gamma)在全球范围内报道了伽玛(Gamma)的遗传序列的兴起,但案例随着三角洲和奥米克隆(Omicron)的兴起而消失。伽玛还在2022年3月被指定为“以前流传的VOC”。
什么是关键突变?《时报》报道,伽玛与β(b.1.351)密切相关,两种变体在其尖峰蛋白中共享一些相同的突变。这些尖峰蛋白突变包括N501Y,该突变有助于病毒与细胞紧密结合,并且在α(B.1.1.7)谱系中也发现。尖峰突变K417T也可能有助于伽马闩锁到细胞上,而E484K突变可能有助于变体躲闪某些抗体。并根据CDC,除了这三个突变外,该变体还带有峰值的八个序列变化:L18F,T20N,P26S,D138Y,R190S,D614G,H655Y和T1027I。
为什么有关变体? 一些 研究 建议该伽玛的传播性比其母体冠状病毒谱系(B.1.1.28)高约两倍,并且该伽马感染与病毒载量明显高于其他变体。与原始的SARS-COV-2菌株相比,伽马表现出对几种单克隆抗体治疗的敏感性,包括Bamlanivimab和Etesevimab。CDC。根据一项研究,于2021年5月12日在《杂志》上发表细胞宿主和微生物,这种变体似乎还相对抵抗康复血浆和从接种疫苗的人中抽取的抗体。
疫苗有效吗?Moderna的Covid-19疫苗可产生针对伽玛的中和抗体,尽管对变体的镜头对这种变体的有效性略低于对病毒的原始菌株,但该公司的效果略低,但是宣布6月29日。辉瑞疫苗在最近的一项研究中显示出对伽马的相似保护水平,业务内部人士报告;根据最近的一项陈述来自公司。
Lambda变体(C.37)
变体出现在哪里?Lambda变体,也称为C.37,于2020年8月首次在秘鲁发现据WHO称。 2021年6月14日,他指定了C.37是全球感兴趣的变种,并将其称为Lambda。
现在在哪里?Lambda在2021年夏天扩散到许多国家,在秘鲁和智利的传播很高,现场科学先前报道。但是到2022年3月,在过去的90天中,世界上没有报道的变种,据WHO称。
什么是关键突变?与武汉检测到的SARS-COV-2的原始菌株相比,该变体在病毒的峰值蛋白中具有七个突变。具体而言,这些突变被称为G75V,T76I,DEL247/253,L452Q,F490S,D614G和T859N。
为什么有关变体?其中一些突变具有增加病毒的可传播性或降低某些抗体中和或失活病毒的能力的潜力。例如,Lambda的突变称为F490S,位于尖峰蛋白的受体结合结构域(RBD)中,该病毒首次停靠在人类细胞上。一篇论文在2021年7月发行的《基因组学》杂志上发表了F490,可能是“疫苗逃生突变”,这既可能使病毒更具传染性并破坏疫苗生成的抗体识别该变体的能力。
疫苗有效吗?根据Lambda循环的时间的数据,并未表明Lambda变体引起了更严重的疾病或疫苗的有效性降低。英国公共卫生。
在变体中(b.1.621)
变体出现在哪里?MU变体,也称为B.1.621,于2021年1月在哥伦比亚首次检测到据WHO称。 8月30日,将其归类为“感兴趣的变体”,并将其命名为MU。
现在在哪里?据世卫组织称,MU变体在2021年在南美和欧洲引起了一些大规模爆发。但是,根据世卫组织(Who Who)的说法,MU变体并没有在循环方面竞争三角洲的变体,并且到2022年3月,在过去的90天中,没有报道的变体在全球范围内报道。
什么是关键突变?MU与Beta变体共享一些有关突变的东西,包括称为E484K和K417N的突变。今天的杂费。
为什么有关变体?官员在2021年8月说,MU变体“具有表明免疫逃逸潜在特性的突变体系”。实验室菜肴中的早期数据表明,响应于COVID-19疫苗接种或先前感染而产生的抗体无法“中性化”,与MU变体的变体“中性”和“与之结合”,与“中性”的能力较低。但是,这一发现仍然需要通过未来的研究来确认。
疫苗有效吗?根据英国公共卫生,“没有针对MU的疫苗有效性的现实数据”。根据英格兰公共卫生的说法,实验室菜肴中的研究发现,抗体中和抗体的能力降低了MU变体的能力,而MU变体“至少与Beta变体一样大”。
Jeanna Bryner,Tia Ghose和Yasemin Saplakoglu为这篇文章做出了贡献。
编者注:此页面的介绍和OMICRON部分最后一次更新于2023年8月8日。
最初发表在现场科学上。