ซึ่งมีต้นกำเนิดในประเทศจีนเมื่อกว่า 3,000 ปีที่แล้ว ได้เปลี่ยนจากสมุนไพรมาเป็นเครื่องดื่มที่บริโภคกันอย่างแพร่หลาย แม้จะมีงานวิจัยจำนวนมากที่มุ่งเน้นไปที่ต้นชาทางตะวันตกเฉียงใต้ของจีน แต่ก็ไม่ค่อยได้รับความสนใจมากนักเกาะไหหลำ- ความคล้ายคลึงกันที่โดดเด่นระหว่างชาไหหลำกับดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัมควบคู่ไปกับสภาพทางภูมิศาสตร์และภูมิอากาศที่เป็นเอกลักษณ์ของเกาะ ทำให้เกิดความท้าทายที่สำคัญในการสืบสวนเกี่ยวกับชาไหหลำ การวิจัยใหม่อุดช่องว่างนี้ด้วยการรวบรวมตัวอย่างต้นชา 500 ตัวอย่างจากไหหลำ และใช้การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดเพื่อตรวจสอบความแตกต่างระหว่างชาไหหลำกับพันธุ์ชาที่ปลูกดอกเคมีเลีย ไซเนนซิส-
กัวและคณะ- ยืนยันตำแหน่งอนุกรมวิธานที่ชัดเจนของชาไหหลำภายในดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสโดยให้ข้อมูลเชิงลึกที่มีคุณค่าสำหรับการอนุรักษ์ทรัพยากรและการปรับปรุงพันธุ์ระดับโมเลกุล เครดิตรูปภาพ: Lin2015
ชาถือเป็นพืชยืนต้นที่เก่าแก่ที่สุดของจีนซึ่งมีประวัติศาสตร์การเลี้ยงมากกว่า 3,000 ปี
ในตอนแรกใช้เป็นสมุนไพรที่มีรากมายาวนานเกือบ 5,000 ปี ต่อมาได้พัฒนาเป็นเครื่องดื่มที่บริโภคกันอย่างแพร่หลาย
ในระดับโลก ต้นชาที่ปลูกแบ่งออกเป็นสองกลุ่มหลัก:ดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.ไซเนนซิสและดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัม-
เกาะไหหลำซึ่งตั้งอยู่ทางตอนเหนือของทะเลจีนใต้ มีประวัติศาสตร์อันยาวนานในด้านการเพาะปลูกต้นชาและพื้นที่ปลูกที่กว้างขวาง
มีรายงานเกี่ยวกับทรัพยากรต้นชาที่อุดมสมบูรณ์บนเกาะไหหลำในช่วงปลายราชวงศ์ชิง
ตัวอย่างเช่น มิชชันนารีชาวอเมริกันและนักพฤกษศาสตร์ Benjamin Couch Henry ค้นพบต้นชาป่าจำนวนมากในระหว่างการสำรวจพื้นที่กลุ่มชาติพันธุ์ Li ในไหหลำอย่างกว้างขวาง ซึ่งยืนยันถึงความอุดมสมบูรณ์ของทรัพยากรต้นชาโบราณบนเกาะ
เนื่องจากที่ราบสูงยูนนาน-กุ้ยโจวได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางว่าเป็นแหล่งกำเนิดทางภูมิศาสตร์ที่มีศักยภาพของชา การศึกษาส่วนใหญ่เกี่ยวกับจีโนมของประชากรต้นชาจึงครอบคลุมตัวอย่างจากจีนตะวันตกเฉียงใต้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัมส่งผลให้งานวิจัยเกี่ยวกับต้นชาในเกาะไหหลำค่อนข้างเบาบาง
“การศึกษาของเราให้ความกระจ่างเกี่ยวกับตำแหน่งทางอนุกรมวิธานของชาไหหลำ และเน้นย้ำถึงความสำคัญของการอนุรักษ์และความพยายามในการเพาะพันธุ์ระดับโมเลกุล” ต้าจง กัว นักวิจัยจากมหาวิทยาลัยเกษตรยูนนาน และเพื่อนร่วมงาน กล่าว
ในการศึกษานี้ ผู้เขียนได้จัดลำดับจีโนมของตัวอย่างต้นชา 500 ตัวอย่าง ซึ่งรวมถึงต้นชาโบราณที่รวบรวมจากแหล่งผลิตชาหลัก 4 แห่งของไห่หนาน ได้แก่ เล่อตง ฉงจง ไป๋ซา และอู๋จื่อซาน
พวกเขาได้รับข้อมูลลำดับดิบทั้งหมด 6.9 เทราไบต์ ซึ่งได้รับการกรองและจัดให้สอดคล้องกับจีโนมอ้างอิง (Yunkang 10) เพื่อให้ได้อัตราการจัดเรียงเฉลี่ยขั้นสุดท้ายที่ 98.98%
หลังจากการเรียกแวเรียนต์ พบ single nucleotide polymorphisms (SNPs) จำนวน 32,334,340 ตัว โดยส่วนใหญ่ตั้งอยู่ในบริเวณที่อยู่ระหว่างพันธุกรรม และส่วนที่เล็กกว่าในบริเวณภายนอก
การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการโดยใช้ข้อมูล SNP พบว่าตัวอย่างชาไหหลำแยกกันเป็นกลุ่มที่แยกจากกลุ่มระดับโลกดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.ไซเนนซิสและดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัมกลุ่มที่มีการจัดกลุ่มทางภูมิศาสตร์ที่โดดเด่นภายในภูมิภาคเทือกเขา Limu แต่ไม่มีรูปแบบที่ชัดเจนในพื้นที่อื่น
การวิเคราะห์โครงสร้างประชากรยังยืนยันอีกว่าชาไหหลำมีองค์ประกอบทางพันธุกรรมที่เป็นเอกลักษณ์เมื่อเปรียบเทียบกับพันธุ์ทั่วโลก
การวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก (PCA) สนับสนุนการค้นพบนี้ ซึ่งแสดงให้เห็นว่าชาไหหลำมีความแตกต่างทางพันธุกรรมดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.ไซเนนซิสและดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัมแม้ว่าจะมีความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมบางอย่างกับทั่วโลกก็ตามดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัม-
นอกจากนี้ การวิเคราะห์การไหลของยีนยังชี้ให้เห็นถึงการอพยพในอดีตอย่างจำกัดระหว่างชาไหหลำกับชาพันธุ์อื่นๆ ซึ่งตอกย้ำถึงสายเลือดทางพันธุกรรมที่แตกต่างกัน
การวิเคราะห์เครือญาติระบุว่าความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่ใกล้ชิดที่พบในตัวอย่างชาไหหลำบางตัวอย่างได้รับอิทธิพลจากกิจกรรมของมนุษย์ในสวนชาที่ได้รับการจัดการ
การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมเผยให้เห็นระดับความหลากหลายที่สูงขึ้นในประชากรไหหลำและภูเขา Limu เมื่อเปรียบเทียบกับดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.ไซเนนซิสและดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสของเรา.อัสสัมโดยมีความแตกต่างทางพันธุกรรมน้อยที่สุดระหว่างชาไหหลำและชาภูเขา Limu
ผลลัพธ์เหล่านี้เน้นย้ำถึงวิถีวิวัฒนาการอันเป็นเอกลักษณ์ของชาไหหลำ โดยให้ข้อมูลเชิงลึกที่มีคุณค่าเกี่ยวกับภูมิหลังทางพันธุกรรม และเสนอนัยสำหรับกลยุทธ์การอนุรักษ์และการปรับปรุงพันธุ์
เอกลักษณ์ทางพันธุกรรมและความหลากหลายสูงของชาไหหลำตอกย้ำศักยภาพของชาไห่หนานในฐานะทรัพยากรที่มีคุณค่าสำหรับโครงการปรับปรุงพันธุ์ในอนาคต
“การศึกษาของเรานำเสนอความเข้าใจที่ลึกซึ้งยิ่งขึ้นเกี่ยวกับวิวัฒนาการของดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสและปูทางสำหรับการวิจัยเพิ่มเติมเกี่ยวกับรากฐานทางพันธุกรรมของชีวิตพืชที่น่าทึ่งของไห่หนาน” นักวิจัยกล่าว
ของพวกเขากระดาษได้รับการตีพิมพ์ในวารสารความหลากหลายทางชีวภาพ-
-
ต้าจง กัวและคณะ- 2024 การจัดลำดับจีโนมใหม่เผยให้เห็นถึงการกำเนิดอย่างอิสระดอกเคมีเลีย ไซเนนซิสความหลากหลาย – ชาไหหลำความหลากหลายทางชีวภาพ1(1): 3-12; สอง: 10.48130/abd-0024-0003