我们今天所生活的世界与我们不远的祖先所生活的世界非常不同。 当我们进入一个新的地质时代时——人类的足迹在其中留下了印记——人们对全球森林砍伐、冰盖融化和总体生物圈退化非常担忧。
但这个新时代的另一个经常被忽视的牺牲品是微生物的多样性(包括细菌、和真菌)生活在我们身上和体内。
如果我们的微生物组(这些生物体的遗传多样性)是微生物煤矿中的金丝雀,那么我与东非狩猎采集者的合作表明它正倒挂在栖息处。
在田野里,我看到一名哈扎猎人熟练地宰杀一只狒狒,并围着火与其他人分享肉。 没有什么会浪费。 包括大脑在内的器官与生结肠和胃一起被消耗。
按照无菌的西方标准,这对于晚餐来说是一个可怕的景象。
无论我多少次看到哈扎人用弓箭宰杀动物,我总是对这个群体与其环境之间非凡的微生物交换感到惊讶。 微生物探戈可能是整个人类进化的特征。
为什么这很重要?最近的研究研究表明,疾病通常与微生物多样性下降有关。 我们不知道因果关系如何运作。
疾病会导致微生物多样性下降,还是多样性下降会导致(或先于)疾病?
现在还为时尚早,还有很多工作要做。 然而,我们携带的微生物以及微生物的多样性可能有助于我们更好地了解和预防疾病,这一想法在医学研究中引发了自 50 多年前抗生素问世以来从未有过的乐观情绪。
这让我想起了哈扎人。
在哈扎人中生活和工作让我想到人类可能与不同微生物群进化出的亲密关系。 每只动物被杀死后,微生物就有机会从一个物种转移到下一个物种。
从灌木丛中采摘的浆果或从富含微生物的土地下挖出的块茎中,哈扎人的每一次觅食行为都使哈扎人与广阔的土地保持着联系。区域(微生物)物种库。
正是他们长期接触这个丰富的微生物库,才赋予了哈扎人非凡的微生物多样性。 比我们在所谓的发达国家中看到的要大得多。
生态与直觉
从生态学的角度来看,西方肠道微生物组多样性较低可能被视为区域物种库退化(所有物种都可在当地定居)或环境过滤器增加(阻碍或阻碍的因素)的结果。限制微生物在环境中的移动,或改变其组成)。
两者的结合可能正在发挥作用。
很多注意力都集中在环境过滤器上,例如饮食,它是西方肠道微生物多样性减少的罪魁祸首。
另一个环境过滤器是抗生素的过度使用。 每个疗程的抗生素都可以减少宿主微生物的多样性。
其他过滤器可能包括在室内度过太多时间, 一个剖腹产率增加和母乳喂养率下降,抗菌产品比如护手霜、小剂量抗生素在我们吃的肉中,以及现代卫生。
但区域物种库的贡献在微生物研究中很少受到关注。 我怀疑这与如此大规模采样的困难有关,当然还有成本和优先事项。
鉴于区域物种库——虽然专注于宏观生物(大到足以用肉眼看到的生物)——是生态学的中心主题,如果将其纳入更多的人类微生物研究中,将是有益的。
考虑到我们经典的抗生素环境过滤示例,人们想知道,服用抗生素并经历微生物多样性减少的人是否不会更快地恢复到抗生素使用前的微生物多样性状态,如果他或她接触到强而有力的环境,是否会恢复到抗生素使用前的微生物多样性状态?一旦抗生素疗程完成,就会形成不同的区域物种库。
当然,对环境过滤器的更多关注和更好的管理将为改善人类微生物多样性带来好处。
然而,更好地了解生态退化可能如何影响到比我们大多数人之前想象的更接近我们自己的肠道的情况,可能会为这一代人最终实现生态系统的健康提供急需的动力小,透视。
重要的是,围绕微生物组的所有讨论可能是动员急需的微环境学家群体的好时机,以更好地教导如何认识我们共同的生物圈所发生的事情的重要性。