这病毒在后面新冠肺炎病毒似乎首先从武汉华南海鲜市场的圈养野生动物传播给人类，现在一项新研究确定了特定动物可能携带病毒。
这项新分析是在市场关闭后不久收集的宏基因组 RNA 数据，也支持了越来越多的证据SARS-CoV-2的起源。
第一个2019 年底，中国湖北省省会武汉爆发了冠状病毒疫情。除了现已不复存在的海鲜和动物市场外，武汉还是中国科学院武汉病毒研究所（WIV）的所在地，科学家们在这里研究冠状病毒。
虽然研究表明 SARS-CoV-2，该病毒与武汉病毒研究所出现在同一个城市，引发了人们的怀疑，并引发了广泛的猜测。例如，即使它是自然进化的，一种流行的理论认为该病毒可能由研究人员从野外采集而来。
有然而，许多病毒学家表示，这种病毒更有可能是从华南海鲜市场的许多其他哺乳动物传播给人类的，那里的条件已经成熟。
为了找到答案，一个国际研究小组对中国疾病预防控制中心 (CDC) 在 2020 年初收集的数据进行了新的分析。
“这是有关 COVID-19 起源的最重要数据集之一大流行”说该研究的资深作者、法国国家科学研究中心（CNRS）的进化生物学家 Florence Débarre。
“我们非常感谢这些数据的存在和共享。”
2020 年元旦，中国疾控中心的调查人员进入华南海鲜市场，当时该市场因新冠肺炎疫情而关闭了几个小时。尽管动物已经不见踪影，但调查小组还是从环境中采集了样本。
该团队最初对饲养动物的棚子表面进行了擦拭，几天后又返回对更多的棚子、笼子和推车进行了擦拭，并从排水沟和下水道收集了样本。
他们还利用宏转录组测序揭示了样本中检测到的每种生物体的每个 RNA 序列以及一些 DNA，并将它们与截至 2020 年 2 月 14 日的 SARS-CoV-2 早期病例的样本进行了比较。
中国疾控中心团队发布他们的发现自然2023 年。他们总共收集了 800 多个样本，虽然他们没有具体说明哪些动物是 SARS-CoV-2 的潜在中间宿主，但他们确实在开放获取存储库上分享了他们的测序数据。
作者解释说，这使得新的分析成为可能，即通过对线粒体基因组进行基因分型来识别样本中的动物种类。
Débarre 与第一作者兼微生物学家 Alexander Crits-Christoph 及其同事在饲养貉和果子狸等动物的棚子中发现了这种病毒的证据。一些样本甚至在一块拭子上同时发现了动物的遗传物质和 SARS-CoV-2。
“许多主要动物物种在中国疾控中心团队抵达之前就已被清除，因此我们无法直接证明这些动物已被感染，”德巴雷说。
她表示：“我们在环境样本中发现了这些动物的 DNA 和 RNA 痕迹，有些动物的棚子里也发现了 SARS-CoV-2。”添加“如果市场上有受感染的动物，就会出现这种情况。”
该研究还包括对 COVID 早期病毒基因组的进化分析，寻找引发大流行的病毒的可能祖先。结果表明，在 COVID 之前几乎没有人类感染过。
“在本文中，我们表明与市场相关的序列与市场的出现是一致的，”Débarre说。“SARS-CoV-2 的主要变异从一开始就存在于市场上。”
根据他们的研究结果，作者列出了市场上最有可能充当。
貉（貉）是样本中遗传最丰富的动物，他们报告说，但来自果子狸的遗传物质（蛤蟆幼虫) 也出现在带有 SARS-CoV-2 RNA 的摊位中。
研究人员指出，这两个物种都与最初的 SARS 爆发有关，而且普通貉对 SARS-CoV-2 具有已知的易感性。
“我们知道，这些动物就是导致最初 SARS 的罪魁祸首新冠病毒2002 年进入人类体内，”说亚利桑那大学生态学家迈克尔·沃罗贝。
“这是我们能做的最危险的事情——带走充满病毒然后让它们与居住在大城市中心的人们接触，这简直就是玩火，因为大城市人口密度高，病毒很容易在这里生根发芽。”沃罗贝说道。添加。
虽然这项新研究并不能证明有任何动物感染了 SARS-CoV-2，但它确实提供了可能有助于未来调查的线索，同时进一步确立了华南市场作为 COVID 的发射台的地位。
“这篇论文为越来越多的证据又增添了一层内容，所有证据都指向同一种情况：受感染的动物于 2019 年 11 月中下旬被引入市场，从而引发了此次疫情。”说美国斯克里普斯研究所进化生物学家克里斯蒂安·安德森。
这不仅对 COVID 起源的回顾性研究有意义，而且对预防。
Worobey 表示：“自四年多前疫情爆发以来，尽管人们越来越关注实验室安全，但并没有采取太多措施来降低此类人畜共患疫情再次发生的可能性。”说。
该研究发表于细胞。
