这在后面似乎是首先从武汉华南海鲜市场的圈养野生动物身上传染给人类的，现在一项新的研究确定了特定的动物可能携带病毒。
新的分析——对市场关闭后不久收集的宏基因组 RNA 数据——也支持积累证据的起源。
第一个2019 年底，他们来到了中国湖北省省会武汉。除了现已不复存在的海鲜和动物市场外，这座城市还是武汉病毒研究所 (WIV) 的所在地，科学家们在那里研究了冠状病毒。
虽然研究表明 SARS-CoV-2其与武汉病毒研究所出现在同一个城市，引起了人们的怀疑并引发了广泛的猜测。例如，即使它是自然进化的，一种流行的理论表明该病毒也可能具有研究人员从野外采集后。
有然而，许多病毒学家表示，病毒更有可能是从华南市场上的许多其他哺乳动物中的一种传播到人类的，那里的条件已经成熟。。
为了弄清楚这一点，一个国际研究小组对中国疾病预防控制中心 (CDC) 2020 年初收集的数据进行了新的分析。
“这是关于 COVID-19 起源的最重要的数据集之一,”说该研究的资深作者、法国国家科学研究中心（CNRS）的进化生物学家 Florence Débarre。
“我们非常感谢这些数据的存在并被共享。”
中国疾病预防控制中心的调查人员于 2020 年元旦进入华南市场，当时市场因新冠肺炎休市数小时后。尽管动物已经消失，研究小组还是从环境中采集了样本。
在最初对饲养动物的畜栏表面进行擦拭后，研究小组在几天后返回，对更多畜栏、笼子和手推车进行擦拭，并从排水沟和下水道中收集样本。
他们还使用宏转录组测序揭示了样本中检测到的每种生物体的每条 RNA 序列以及一些 DNA，并将这些序列与截至 2020 年 2 月 14 日的早期 SARS-CoV-2 病例的样本进行了比较。
中国疾控中心团队发表他们的发现自然2023 年。他们总共拥有 800 多个样本，虽然他们没有具体说明哪些动物是 SARS-CoV-2 的潜在中间宿主，但他们确实在开放获取存储库上分享了测序数据。
作者解释说，这使得新的分析成为可能，该分析通过对线粒体基因组进行基因分型来识别样本中的动物物种。
德巴尔与第一作者、微生物学家亚历山大·克里茨·克里斯托夫 (Alexander Crits-Christoph) 及其同事一起，在饲养貉和果子狸等动物的摊位中发现了该病毒的证据。有些样本甚至在一根拭子上同时含有来自动物和 SARS-CoV-2 的遗传物质。
德巴尔说：“在中国疾病预防控制中心团队到达之前，许多关键动物物种已经被清除，因此我们无法获得这些动物被感染的直接证据。”说。
她说：“我们在环境样本中看到了这些动物的 DNA 和 RNA 幽灵，有些动物的畜栏里也发现了 SARS-CoV-2。”添加。 “在市场上有受感染动物的情况下，这就是你所期望的。”
该研究还对新冠病毒早期的病毒基因组进行了进化分析，寻找引发这场大流行的病毒的可能祖先。结果表明，之前几乎没有人被感染过。
“在本文中，我们表明与市场相关的序列与市场的出现是一致的，”Débarre说。 “SARS-CoV-2 的主要多样性从一开始就存在于市场中。”
根据他们的发现，作者创建了市场上最有可能充当动物物种的简短清单。
普通貉（貉他们报告说，）是样本中基因最丰富的动物，但来自果子狸的遗传物质（蛤蟆幼虫）也出现在一个摊位上，里面有 SARS-CoV-2 的 RNA。
研究人员指出，这两个物种都与最初的 SARS 爆发有关，并且普通貉对 SARS-CoV-2 具有已知的易感性。
“我们知道，这些动物与最初的 SARS 的传播者是同一种动物。2002年跳入人类体内，”说亚利桑那大学的生态学家迈克尔·沃罗比。
“这是我们能做的最危险的事情——捕获大量的野生动物然后让他们与生活在大城市中心的人类接触，这是在玩火，因为大城市的人口密度使这些病毒很容易扎根。”添加。
虽然这项新研究并未证明任何动物感染了 SARS-CoV-2，但它确实提供了有助于未来调查的线索，并进一步将华南市场确立为新冠病毒的发射台。
“这篇论文为不断积累的证据增添了另一层证据，所有证据都指向同一场景：受感染的动物于 2019 年 11 月中下旬被引入市场，从而引发了大流行，”说美国斯克里普斯研究所的进化生物学家克里斯蒂安·安德森。
这不仅与新冠病毒起源的回顾性研究相关，而且对于预防。
沃罗贝表示：“自从四年多前大流行开始以来，尽管人们越来越关注实验室安全，但在减少类似的人畜共患病再次发生的可能性方面却没有采取太多措施。”说。
该研究发表于细胞。
