'怎么做到的进化”是一个简单的问题,导致调查,猜测, 和彻头彻尾的阴谋。
目前,研究表明,这极有可能是负责自然进化——可能从蝙蝠开始,然后无辜地渗透到动物宿主中,直到它发展出必要的突变,使其成为全球性的我们今天看到了。
一项新的研究更加证实了这一理论,发现了一种近亲蝙蝠体内的病毒,包括类似的插入事件——将遗传物质“插入”病毒基因组的突变——表明病毒构成的这种变化可以而且确实会自然发生。
“自从发现 SARS-CoV-2 以来,有许多毫无根据的建议表明该病毒源自实验室,”山东第一医科大学微生物学家史伟峰说。
“特别是,有人提出 S1/S2 插入非常不寻常,可能表明实验室操纵。我们的论文非常清楚地表明这些事件在野生动物中自然发生。这提供了强有力的证据,证明 SARS-CoV-2 是实验室逃逸”。
这种新发现的蝙蝠冠状病毒被研究小组命名为 RmYN02,是在对 2019 年下半年在中国云南省收集的 227 只蝙蝠的 302 份样本进行分析时发现的。
分析之后在这些蝙蝠样本中,研究小组发现了两个几乎完整的冠状病毒基因组——RmYN01和RmYN02。
RmYN01 与 SARS-CoV-2 的匹配度较低。但 RmYN02 算是中了大奖。这种冠状病毒与 SARS-CoV-2 的基因组有 93.3% 的相似度,其中一个名为 1ab 的特定基因有 97.2% 的相似度,这是迄今为止该基因中最接近的匹配。
然后是插入事件。 RmYN02 包含氨基酸插入在其刺突蛋白的两个亚基(S1 和 S2)相遇的位置。 SARS-CoV-2 也有 S1 和 S2 插入——它们在两种病毒中不是相同的氨基酸,但它表明这些插入可以自然发生,不需要实验室。
尽管有相似之处,但这并不意味着 RmYN02 是在世界各地引起 COVID-19 的病毒的直接祖先——特别是考虑到最重要的基因受体结合域与 SARS-CoV-2 的匹配度非常低,仅为 61.3%。
但是,如果我们想了解 SARS-CoV-2 病毒如何进化成今天的样子,找到新的冠状病毒基因组将非常有帮助。
“我们的研究重申,蝙蝠,尤其是蝙蝠属的蝙蝠菊头蝠属[马蹄蝠]是冠状病毒的重要天然宿主,目前是 SARS-CoV-2 的近亲,尽管这种情况可能会随着野生动物采样的增加而改变,”该团队在他们的研究中写道。
“在这种情况下,令人震惊的是,这里发现的 RmYN02 病毒马来菊头蝠尽管病毒本身具有复杂的重组历史,但在长 1ab 复制酶基因中,它是 SARS-CoV-2 的最近亲。”
迄今为止,我们发现的与 SARS-CoV-2 最接近的病毒是一种名为 RaTG13 的蝙蝠冠状病毒,其 RNA 匹配率为 96.1%,但很可能还有更接近的病毒。
“RaTG13 和 RmYN02 都不是 SARS-CoV-2 的直接祖先,因为这些病毒之间仍然存在进化差距,”石解释道。
“我们的研究强烈表明,对更多野生动物物种进行采样将揭示与 SARS-CoV-2 甚至可能是其直接祖先更密切相关的病毒,这将告诉我们有关这种病毒如何在人类中出现的大量信息。”
该研究发表于现代生物学。