两个生态种幽门螺杆菌根据一项新的研究,在现代人类离开非洲并通过人类迁徙散布到世界各地之前,它们就被命名为“Hardy”和“Ubiquitous”。
1983年首次发现,幽门螺杆菌在人类宿主的长期定植过程中,它会扰乱胃壁,造成溃疡和胃癌等后遗症。
很多的幽门螺杆菌毒力因子已被确定,显示出广泛的地理差异。
在这项新研究中,上海免疫与感染研究所的 Elise Tourette 博士及其同事史无前例地收集了 6,864幽门螺杆菌来自世界各地的基因组来研究细菌的传播。
他们意外地发现了一种高度独特的变体幽门螺杆菌他们将其称为“哈代生态种”,它出现在数十万年前,并随着人类传播到世界各地。
他们提出,该生态种专门生活在饮食主要由肉或鱼组成的人(即食肉动物)的胃中。
因此,今天在我们胃里的细菌中发现的遗传变异可以告诉我们我们的祖先吃什么。
“我们多样化的全球样本使我们能够更好地了解螺杆菌图雷特博士说:“这证实了之前的发现,即五万多年前我们离开非洲时,这些细菌就已经是我们胃里的乘客了。”
“然而,我们也发现了一些令人惊讶的事情,即一种新的生态种螺杆菌,我们称之为哈代。”
“它与常见类型(我们称之为无处不在)的不同之处在于 100 多个基因。”
“事实证明,哈代生态物种对于细菌在我们的胃中生存需要做什么,而且更重要的是,关于如何维持细菌的多样性提供了非常丰富的信息。”
“当今的大多数人类都是杂食动物或素食主义者,这意味着我们的饮食中很大一部分由植物材料组成,”同样来自上海免疫与感染研究所的 Daniel Falush 博士说。
“然而,在世界某些地区,历史上一年中的大部分时间都无法获得植物材料,人们严重依赖鱼或肉来维持生计。”
“到目前为止,仅在西伯利亚和加拿大北部等地的土著人群中发现了哈迪生态种。”
“由于古老的宿主跳跃,在动物园的老虎和猎豹中也发现了它,并且具有关键的遗传差异,可以使其适应食肉动物胃中的条件。”
“这种关联特别有趣,因为我们的分析还表明,自从我们物种在 20 万多年前起源于非洲以来,这两个生态物种就伴随着人类。”
“如果生态物种确实适应了食肉动物,那么这意味着分布在世界各地的人类通常不会吃太多植物物质,即使他们可以获得植物物质。”
通过分析幽门螺杆菌通过对世界各地的基因组进行分析,研究人员发现,第一批现代人类感染了两种不同类型的细菌:哈迪细菌和无处不在的细菌。
在人类早期迁徙过程中,这两种生态物种都从非洲扩散出去,最远到达了南美洲。
迄今为止,在所有采样的人类群体中都发现了无处不在的生态种,但哈代生态种仅从少数土著群体中采样,这意味着它可能在其迁徙路径上的许多地方已经灭绝。
然而,非洲的一个哈迪品系将宿主转移到大型猫科动物身上,并在动物园中与猎豹、狮子和老虎分离。
了解为什么生态种可以在某些种群中共存,但在其他种群中却不能共存,这有望揭示我们的史前史以及我们今天仍然遭受的胃病的沉重负担。
科学家们说:“我们的结果还表明,即使在菌株之间存在持续的遗传交换的情况下,细菌群体中也可以出现并稳定维持高度独特的适应性策略。”
这发现发表在杂志上自然。
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E·图雷特等人。一个古老的生态种幽门螺杆菌。自然,2024 年 10 月 16 日在线发布;编号:10.1038/s41586-024-07991-z