一项令人震惊的研究声称基因编辑技术CRISPR可以产生数百个意想不到的突变其作者现在已经对基因组编辑进行了跟踪,他们说他们无法复制他们有争议的结果。
致谢——以报告没有引入此类突变的新小鼠实验从技术上讲并不是对他们早期发现的撤回,但它在很大程度上表明警钟可能从一开始就不应该敲响。
在这项新研究中,研究小组对两个经过 CRISPR 编辑程序的小鼠品系进行了全基因组测序。
在他们最初的研究中,他们进行了相同的分析——这是第一次在活体上进行全基因组测序基因编辑。
但与最初的结果不同的是,在新的实验中,基因改变后没有出现意外的基因变异。
这与该团队的第一项研究形成鲜明对比,在该研究中,他们发现两只经过 CRISPR 编辑的小鼠持续了 1,500 多个单核苷酸突变,以及 100 多个非预期的较大删除和插入。
这些变异出现在动物基因组的“脱靶”部分,这表明虽然 CRISPR 编辑可以改变遗传密码以修复某些异常,但它也可能在基因组的其他地方引入不需要的突变。
“我们认为,科学界必须考虑 CRISPR 引起的所有脱靶突变的潜在危险,”该团队成员之一、哥伦比亚大学细胞生物学家 Stephen Tsang 说道。当时说。
这是一个合理的担忧,也是我们当然应该留意的。
但是其他科学家遇到的问题这些令人震惊的发现并不是与团队的“大局”方法有关,而是与他们的方法的缺点。
出版后不久,一则对原论文的批评另一个团队指出,实验中的两只基因编辑小鼠在基因上比第三只“对照”小鼠彼此之间的关系更密切。
这意味着 Tsang 团队检测到的“意外突变”并不是 CRISPR 的结果,而仅仅是由于选择用于研究的小鼠预先存在的基因所致。
由于实验中的动物样本太小,结果不仅不可靠,而且具有误导性——特别是研究人员直言不讳地说这种分析以前从未做过,暗示它揭示了CRISPR 的危险缺点。
由于原始研究存在争议和担忧,编辑们自然方法– 发表论文的期刊 – 正式声明他们是担心的关于研究结果的准确性,考虑到“另一种建议的解释是观察到的变化是由于正常的遗传变异造成的”。
尽管曾荫权的团队并不认同这些担忧,但他们仍然非常关心,并在他们的报告中重新审视了此事。新研究,以及他们的有待更正(更正)分析是对 CRISPR 的辩护,承认“意外突变”假设,据我们所说,是一个错误,仅此而已。
在捍卫他们对这种意外突变的“合理担忧”的同时,尽管如此,作者仍得出结论新结果“支持这样的观点,即在特定情况下,CRISPR-Cas9编辑可以在有机体水平上精确编辑基因组,并且可能不会引入大量、非预期的脱靶突变”。
这一切都是一件好事。这是科学方法在起作用,根据新信息修改我们的解释,而有些人正在争论原始论文最终应该被撤回,这还没有发生。
很多可能是仍然生气原来的论文是全部发表。但至少现在,新的数据已经曝光,我们仍然从这项研究中学到了一些重要的东西。
初步调查结果可在预印本网站上获取生物Rxiv。
更新(2018 年 4 月 3 日):自然方法已正式撤回原始研究,您可以在这里阅读完整的撤回通知。