到目前为止，重组谱系似乎并没有传播得那么快。图片来源：CKA/Shutterstock
您听说过“Deltacron”变种吗？一半是Delta，一半是Omicron；它在美国流行之前最初是法语，并且有一个美味的名字组合，COVID-19 变种。
当这种混合病毒——或者用科学术语来说，重组病毒——首次出现时，它是。两个血统并不是在现实世界中混合的，而是在培养皿中混合的。但现在，仅仅两个月后，Delta-Omicron 重组体就真的出现了——周一发表的一篇论文预印本BioRxiv 服务器上有证据。
“鉴于 Delta 和 Omicron 基因组的差异，以及 Omicron 已知的免疫逃逸特性，Delta-Omicron 重组菌株可能会改变疫苗和治疗效果的格局，”该论文解释道。
“在这份报告中，我们从 CDC 的国家基因组监测中确定了候选 Delta-Omicron 重组基因组……我们表明这些基因组很可能是 Spike 基因内重组的结果，包含 Delta 谱系……和 Omicron 谱系常见的替换[。]”
但这一切究竟意味着什么呢？好吧，在我们开始讨论之前，重要的是要记住重组体的出现并不令人惊讶。与任何病毒一样，COVID-19 是预印本合著者 Tom Peacock 解释说，“当两种相关病毒感染同一个细胞时（即在共同感染期间），病毒复制机制可能会意外地从一个基因组切换到另一个基因组，从而导致混合基因组。”
“这是病毒重组，”他在一篇文章中写道。推特话题介绍调查结果。 “[SARS-CoV-2，导致 COVID-19 的病毒]在整个大流行期间一直在这样做 - 然而，只有当这两种亲代病毒关系较远时才容易看出。”
基本上，你应该尝试忽略任何暗示 Delta-Omicron 重组体纯粹因为其混合性质而格外危险的头条新闻——COVID-19 一直在这样做。事实上，一种 Alpha-Delta 重组体出现了十月回来，而且它在病毒学界之外几乎没有引起任何关注。
也就是说，对于以 Omicron 和 Delta 为父母的变体，我们应该有多担心？通过详细的序列分析，并确保这不是另一个实验室错误，研究人员证实新谱系具有具有 Delta 和 Omicron 变体特征的刺突蛋白。
重要的是，受体结合域（刺突蛋白中附着在人类细胞上并让病毒颗粒进入其中的部分）中没有出现 Omicron 变体中未见的额外氨基酸突变。皮科克表示，这可能是个好消息。
“我认为（但希望看到证据来证明这一点！）它在抗原上应该更像 [Omicron]，”他写了。 “[所以]疫苗的作用类似于[Omicron]。”
这是另一个充满希望的迹象：到目前为止，重组谱系似乎并没有传播得那么快。
预印本指出：“尽管在 6 周的时间里才被检测到，但由这些混合 Spike 重组病毒引起的病例数量仍然很低。” “此外，大多数病例是在美国大西洋中部地区发现的。”
然而，重组谱系不会很快消失。我们可能很幸运地获得了这种特殊的混合变体，但研究人员知道，下一个——而且还会有下一个——可能会更糟。
该论文指出：“通过国家基因组监测对引起 COVID-19 的病毒 SARS-CoV-2 的新变种进行了表征和密切监测。”
“考虑到重组产生的新变种可能对公共健康造成影响，涉及实验室和生物信息学成分的调查（例如本文中介绍的）对于正确识别和追踪这些病毒至关重要。”
