根據對古代蛋白質的分析，2000年代在台灣澎湖海峽發現的一具具有19萬至1萬年曆史的下頜骨化石屬於男性丹尼索瓦人。這一發現提供了直接證據，表明丹尼索瓦人生活在多種氣候中，從寒冷的西伯利亞山脈到溫暖潮濕的台灣亞熱帶緯度。
藝術家想像中的台灣更新世時期，澎湖丹尼索瓦人在明亮的陽光下行走。圖片來源：孫成漢。
哥本哈根大學和高等研究研究生院 (SOKENDAI) 的研究員 Takumi Tsutaya 博士及其同事說：“最近對化石標本的發現和重新分析，加上分子技術和新的年代測定方法的應用，揭示了更新世中晚更新世（現代人類到來之前）東亞古人類的意想不到的多樣性。”
“丹尼索瓦人的識別是此類進步的一個重要例子。”
“丹尼索瓦人被認為是一個不同於尼安德特人和現代人類的古人類群體從西伯利亞阿爾泰山脈的丹尼索瓦洞穴中挖掘出的骨骼和牙齒碎片的 DNA。 ”
“他們的核基因組表明，丹尼索瓦人形成了自己的進化枝，作為尼安德特人的姐妹群體，根據計算，這兩個進化枝之間的基因組差異發生在 40 萬多年前。”
“遺傳證據還表明丹尼索瓦人、現代人類和尼安德特人之間的基因流動。”
“對現代人類群體中漸滲的丹尼索瓦人 DNA 的研究表明，存在多個基因組不同的丹尼索瓦人群體，這些群體曾經廣泛分佈於東亞大陸，也可能分佈在東南亞島嶼的某些地區。”
“然而，在丹尼索瓦洞穴之外，丹尼索瓦人的直接分子證據僅得到了證實。來自青藏高原的一個地點。 ”
“在夏河白石崖溶洞，已發現下頜骨和肋骨。根據其蛋白質序列，將其識別為丹尼索瓦人。 ”
貼上標籤澎湖1號新的丹尼索瓦人化石是在 2000 年代通過與商業捕魚相關的疏浚活動在距離台灣西海岸約 25 公里的海底（60 至 120 m 深）收集的。
該地區位於丹尼索瓦溶洞東南4000公里、白石崖溶洞東南2000公里處。
在更新世低海平面時期，它是亞洲大陸的一部分。
研究人員表示：“根據微量元素含量、生物地層證據和過去的海平面變化，澎湖一號的年齡小於45萬年，最有可能的年齡範圍為10,000至70,000年或130,000至190,000年。”
“澎湖一號的直接鈾測年沒有成功，因為受到海水中鈾的影響。”
Tsutaya 博士及其同事利用古代蛋白質組學分析，從化石中的骨骼和牙釉質中提取了蛋白質，並檢索到了 4,241 個氨基酸殘基，其中兩個是丹尼索瓦人特有的蛋白質變體。
這些變異在現代人群中很少見，但在與丹尼索瓦人基因滲入相關的區域中出現頻率較高。
更重要的是，澎湖一號遺骸的形態分析揭示了一個堅固的頜骨結構，具有大臼齒和獨特的根部結構，這些特徵與西藏丹尼索瓦人標本中所見的特徵一致，表明這些特徵是該譜系的特徵，並且可能具有性別特異性。
科學家們說：“現在很明顯，兩個截然不同的古人類群體——小齒尼安德特人，下頜骨高大而纖細，大齒丹尼索瓦人，下頜骨低矮但堅固（作為一個群體或男性角色）——在歐亞大陸中更新世晚期至晚更新世早期共存。”
“由於後一種形態在非洲和歐亞大陸的早更新世晚期至中更新世早期化石中很少見或不存在，因此它們並不像之前所認為的那樣是原始保留，而是可能在 40 萬多年前與尼安德特人進行遺傳分離後在丹尼索瓦人分支中發展或增強。”
“最近來自東南亞島嶼的發現（弗洛勒斯人和呂宋人）和南非（我生來就是個男人）突出該屬的多樣化進化人屬，與導致的譜系形成對比一個聰明人”。
“丹尼索瓦人的牙頜形態可以解釋為我們屬中發生的另一種獨特的進化。”
這結果今天發表在雜誌上科學。
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蔦屋匠海等人。 2025 年，台灣更新世的雄性丹尼索瓦人下頜骨。科學388（6743）：176-180； DOI：10.1126/science.ads3888
