所謂的i-motifs是在人類細胞核中形成的結狀DNA結構,並被認為提供了關鍵的基因組調節。在新研究中,科學家加文醫學研究所Elswhere使用免疫沉澱和下一代測序來識別人DNA中的I-MotiF結構。
佩尼亞·馬丁內斯等。在三個人類細胞系中共有53,000個I-motifs:MCF7,U2OS,HEK293T。圖片來源:PeñaMartinez等。,兩個:10.1038/s44318-024-00210-5。
是與標誌性雙螺旋形不同的DNA結構。
當相同的DNA鏈上的胞質字母彼此之間伸展時,它們會形成,從而形成了一個四鏈的扭曲結構,從雙螺旋伸出。
2018年,Garvan醫學研究所的科學家是第一個使用他們開發的新的抗體工具直接可視化生物細胞內的I-MOTIF,以識別和附著於I-MOTIF。
這項新的研究是基於這些發現的基礎,通過部署這種抗體來識別整個基因組中的I-MOTIF位置。
這項研究的高級作者丹尼爾·基督教教授丹尼爾·克里斯(Daniel Christ)說:“在這項研究中,我們在人類基因組中繪製了50,000多個I-motif網站,這些地點發生在我們檢查的所有三種細胞類型中。”
“對於曾經被認為是有爭議的DNA結構的DNA結構來說,這是一個非常高的數量。”
“我們的發現證實,i-Motifs不僅是實驗室的好奇心,而且是廣泛的,並且可能在基因組功能中起關鍵作用。”
研究人員發現,i-motifs不是隨機分散的,而是集中在基因組的關鍵功能區域,包括控制基因活性的區域。
“我們發現I-MOTIF與在細胞週期中特定時間高度活躍的基因有關,” Garvan醫學研究所的第一作者Cristian DavidPeñaMartinez博士說。
“這表明它們在調節基因活性中起動態作用。”
“我們還發現,i-motifs在癌基因的啟動子區域中形成,例如媽媽癌基因編碼癌症最臭名昭著的“不難”目標之一。”
“這為通過I-MoTIF結構靶向疾病相關的基因提供了一個令人興奮的機會。”
該研究的共同作者,Garvan醫學研究所的研究人員Sarah Kummerfeld博士說:“這些涉及難以治療的癌症的'聖杯'序列附近的I-MoTIF的存在為新的診斷和治療方法開闢了新的可能性。”
“有可能設計靶向i-motifs來影響基因表達的藥物,從而擴大當前治療方案。”
團隊的結果發表在EMBO期刊。
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克里斯蒂安·戴維·佩尼亞·馬丁內斯等。人基因組DNA被廣泛散佈在i-motif結構中。Embo j,於2024年8月29日在線發布; doi:10.1038/s44318-024-00210-5