阴谋论之一一直困扰着让人们了解情况的努力的想法是创建于一个实验室。但绝大多数研究过的科学家同意它自然进化并从动物物种（最有可能是蝙蝠）杂交到人类。
我们到底如何知道这种病毒，，具有“人畜共患”动物来源而不是人造来源吗？答案在于病毒的遗传物质和进化历史，以及对相关蝙蝠生态的了解。
据估计，人类已知传染病的 60% 以及所有新发疾病、新出现疾病或复发疾病的 75%有动物起源。 SARS-CoV-2 是人类发现的七种冠状病毒中最新的一种，所有这些病毒来自动物，来自蝙蝠、老鼠或家畜。
蝙蝠也曾是病毒的来源导致、狂犬病、尼帕病毒和亨德拉病毒感染、马尔堡病毒病以及一种病毒。
SARS-CoV-2 的基因组成或“基因组”已被测序并公开分享世界各地的科学家已经研究了数千次。如果该病毒是在实验室进行基因工程改造的，那么基因组数据就会有被操纵的迹象。
这将包括现有病毒序列作为新病毒主干的证据，以及明显的、有针对性的插入（或删除）遗传元件。
但不存在这样的证据。任何用于对病毒进行基因改造的技术都不太可能不留下痕迹。遗传特征，就像特定的可识别的 DNA 代码片段。
SARS-CoV-2 的基因组与其他蝙蝠冠状病毒以及穿山甲的基因组相似，它们都具有相似的整体基因组结构。这些冠状病毒基因组之间的差异显示出典型的自然模式冠状病毒进化。这表明 SARS-CoV-2演化自以前的野生冠状病毒。
SARS-CoV-2 与其他冠状病毒不同的关键特征之一是一种特殊的“刺突”蛋白，它可以与人类细胞外部的另一种蛋白很好地结合称为 ACE2。这使得病毒能够附着并感染多种人体细胞。
然而，其他相关的冠状病毒确实有相似的特征，提供证据证明它们是自然进化的，而不是在实验室中人工添加的。
冠状病毒和蝙蝠被锁在一个进化军备竞赛其中是不断发展为了逃避蝙蝠的免疫系统，蝙蝠正在进化以抵御冠状病毒的感染。一种病毒会进化出多种变体，其中大部分会被蝙蝠的免疫系统消灭，但有些会存活下来并传播给其他蝙蝠。
一些科学家有研究表明，SARS-CoV-2可能来自武汉病毒研究所研究人员发现的另一种已知蝙蝠病毒（RaTG13）。这两种病毒的基因组相似度高达 96%。
这听起来可能非常接近，但从进化的角度来看，这实际上使它们显着不同并且两者已被证明共享一个共同祖先。这表明RaGT13并不是SARS-CoV-2的祖先。
事实上，SARS-CoV-2 很可能是从一种无法长时间存活或在蝙蝠体内持续保持低水平的病毒变种进化而来。
巧合的是，它进化出了侵入人体细胞的能力，并意外地进入了我们体内，可能是通过一种中间动物宿主，然后它就在那里蓬勃发展。或者，最初无害的病毒可能会直接进入人类体内，然后在人与人之间传播时进化为有害的。
遗传变异
自然界中不同冠状病毒基因组的混合或“重组”是产生新型冠状病毒的机制之一。现在有进一步的证据表明这一过程可能涉及SARS-CoV-2 的产生。
自大流行开始以来，SARS-CoV-2 病毒似乎已开始演变成两种不同的菌株，获得更有效地入侵人体细胞的适应能力。这可能是通过一种称为选择性清除的机制发生的，通过这种机制，有益的突变可以帮助病毒感染更多宿主，从而在病毒群体中变得更加常见。
这是一个自然过程，最终可以减少个体病毒基因组之间的遗传变异。
同样的机制可以解释缺乏多样性在许多已测序的 SARs-CoV-2 基因组中都可以看到。这表明 SARS-CoV-2 的祖先可能已经在蝙蝠种群中传播了很长时间相当长的时间。然后它就会获得突变，使其能够从蝙蝠传播到包括人类在内的其他动物身上。
同样重要的是要记住，地球上所有哺乳动物物种中约有五分之一是蝙蝠，其中一些仅在某些地点发现，而另一些则跨越很远的距离迁徙。这多样性和地理分布这使得确定 SARS-CoV-2 最初来自哪一组蝙蝠成为一项挑战。
有证据早期的案例该事件发生在中国武汉市以外，与该市的菜市场没有明确的联系，据信该市场是大流行的开始地。但这并不是阴谋的证据。
可能只是感染者不小心将病毒带入城市，然后进入菜市场，那里封闭、繁忙的环境增加了疾病迅速传播的机会。
这包括一名参与武汉蝙蝠冠状病毒研究的科学家在不知情的情况下被感染的可能性，以及把病毒带回来来自他们的主题蝙蝠居住的地方。这仍然被认为是自然感染，而不是实验室泄漏。
只有通过强大的科学和对自然世界的研究，我们才能真正了解像 COVID-19 这样的人畜共患疾病的自然历史和起源。这是相关的，因为我们不断变化的关系以及与野生动物的接触不断增加，正在增加人类出现新的致命人畜共患疾病的风险。
SARS-CoV-2 不是我们从动物身上获得的第一种病毒，当然也不会是最后一种。
