科学家刚刚发现了数百种可能导致癌症的基因
(理查德·琼斯/科学图片库/盖蒂图片社)
科学家发现了数百个可能促进癌症新的研究表明。
癌症通常是由某种基因编码变化引发的,这种变化会干扰细胞控制其生长的能力。针对这些干扰,采用量身定制的治疗方法通常可以防止肿瘤失控扩散。
到目前为止,已知有 600 多个基因的序列发生突变会导致肿瘤。然而,在基因转录和最终产物之间的通路上,癌症也可能以其他方式出现。
该领域之前的研究大多关注的是异常情况这项研究调查了 DNA 指令传递至身体其他部位时出现的异常情况。
西班牙巴塞罗那科学技术研究所 (BIST) 的研究人员使用精心构建的算法来寻找与外显子:直接翻译成蛋白质的遗传序列部分。
基因的非编码部分称为内含子,通常在基因的 DNA 转录为 RNA 版本时被去除,这个过程称为剪接.癌细胞可以干扰剪接,从正常的、未突变的蛋白质基因中产生突变的蛋白质。
研究团队利用精心构建的算法来识别 813 个基因,这些基因在拼接后可以促进癌症生长。
这一广泛的新类别扩大了我们的致癌基因列表,以现有的 626 个已知突变会导致肿瘤的基因列表为基础。事实上,最广泛使用的癌症突变数据库记录了可以驱动癌症生长的基因,其中只有大约十分之一的“剪接”类基因已被纳入。
“当考虑到剪接等非突变机制时,我们认为控制癌症的潜在基因靶点可能会增加一倍。”说BIST 生物学家 Miquel Anglada-Girotto。
“这些不是经典的致癌基因,而是代表了一类全新的潜在癌症驱动因素,可以单独针对它们,也可以与现有策略协同针对它们。”
研究人员的算法名为 Spotter,能够挖掘大量基因数据,识别出可能为癌症提供更好生长机会的剪接事件。在对组织样本进行的小规模实验室测试中,针对这些外显子确实限制了样本中癌症的生长。
“Spotter 不仅可以识别潜在的癌症驱动外显子,然后我们可以将其追溯到基因,而且它还可以对任何给定的癌症样本中哪些外显子比其他外显子更重要进行排序,”说安格拉达-吉罗托。
识别这些外显子的用处还不止于此:进一步分析,将这项研究的数据与药物治疗结果数据库相结合,表明剪接的变化可以帮助预测不同患者对药物的不同反应。。
虽然我们还需要做很多工作才能定期突出和定位基因内的外显子,但这项研究表明,我们很有可能做到这一点。我们所能利用的越多越好。
“这是一个令人难以置信的令人兴奋的新领域,值得探索。”说安格拉达-吉罗托。
该研究已发表于自然通讯。