一項令人震驚的研究聲稱基因編輯技術CRISPR可以產生數百個意想不到的突變其作者現在已經對基因組編輯進行了跟踪,他們說他們無法複製他們有爭議的結果。
致謝——以報告沒有引入此類突變的新小鼠實驗從技術上講並不是對他們早期發現的撤回,但它在很大程度上表明警鐘可能從一開始就不應該敲響。
在這項新研究中,研究小組對兩個經過 CRISPR 編輯程式的小鼠品系進行了全基因組定序。
在他們最初的研究中,他們進行了相同的分析——這是第一次在活體上進行全基因組定序基因編輯。
但與最初的結果不同的是,在新的實驗中,基因改變後並沒有出現意外的基因變異。
這與團隊的第一項研究形成鮮明對比,在該研究中,他們發現兩隻經過CRISPR 編輯的小鼠持續了1,500 多個單核苷酸突變,以及100 多個非預期的較大刪除和插入。
這些變異出現在動物基因組的「脫靶」部分,這表明雖然 CRISPR 編輯可以改變遺傳密碼以修復某些異常,但它也可能在基因組的其他地方引入不必要的突變。
「我們認為,科學界必須考慮 CRISPR 引起的所有脫靶突變的潛在危險,」該團隊成員之一、哥倫比亞大學細胞生物學家 Stephen Tsang 說。當時說。
這是一個合理的擔憂,也是我們當然應該留意的。
但是其他科學家遇到的問題這些令人震驚的發現並不是與團隊的「大局」方法有關,而是與他們的方法的缺點。
出版後不久,一則對原論文的批評另一個團隊指出,實驗中的兩隻基因編輯小鼠在基因上比第三隻「對照」小鼠彼此之間的關係更密切。
這意味著 Tsang 團隊檢測到的「意外突變」並不是 CRISPR 的結果,而只是由於選擇用於研究的小鼠預先存在的基因所致。
由於實驗中的動物樣本太小,結果不僅不可靠,而且具有誤導性——特別是研究人員直言不諱地說這種分析以前從未做過,暗示它揭示了CRISPR 的危險缺點。
由於原始研究有爭議和擔憂,編輯們自然方法– 發表論文的期刊 – 正式聲明他們是擔心的關於研究結果的準確性,考慮到「另一種建議的解釋是觀察到的變化是由於正常的遺傳變異造成的」。
儘管曾蔭權的團隊並不認同這些擔憂,但他們仍然非常關心,並在他們的報告中重新審視了這件事。新研究,以及他們的有待更正(更正)分析是對 CRISPR 的辯護,承認「意外突變」假設,據我們所說,是一個錯誤,僅此而已。
在捍衛他們對這種意外突變的「合理擔憂」的同時,儘管如此,作者仍得出結論新結果「支持這樣的觀點,即在特定情況下,CRISPR-Cas9編輯可以在有機體層面上精確編輯基因組,並且可能不會引入大量、非預期的脫靶突變」。
這一切都是一件好事。這是科學方法在起作用,根據新資訊修改我們的解釋,而有些人正在爭論原始論文最終應該被撤回,這還沒有發生。
很多可能是仍然生氣原來的論文是全部發表。但至少現在,新的數據已經曝光,我們仍然從這項研究中學到了一些重要的東西。
初步調查結果可在預印本網站上取得生物Rxiv。
更新(2018 年 4 月 3 日):自然方法已正式撤回原始研究,您可以在這裡閱讀完整的撤回通知。