一种新的混合动力称为 XE 的变体具有引发新的担忧最近。
XE 是高传播性 BA.1 和 BA.2 Omicron 变体的组合,并且是第一个在英国检测到一月中旬。 其刺突蛋白源自 BA.2,这对新西兰来说可能是个好消息,因为这是主要变体(占近期感染的 90% 以上),并且已感染的人应该针对 XE 采取一些保护措施。
迄今为止,全球约有 700 个病毒基因组已被分配 XE。 该变种主要在英国发现,目前在泰国和美国等其他地方也发现了少数病例,很可能是由于旅行相关的传播。
根据目前来自英国的估计,XE 比 BA.2 具有轻微(5-10%)的传输优势,这将使其成为迄今为止确定的 Omicron 传输性最强的子变体。 每当出现新的更具传播性的变体时,随着时间的推移,它就有可能成为主要变体。
XE 尚未分配自己的希腊字母。 目前,它属于 Omicron,直到确定传播和疾病特征(包括严重程度)的显着差异。
到目前为止,还没有足够的证据可以对 XE 的传播能力得出可靠的结论,而且几乎没有关于其严重性或逃避免疫能力的数据。
混合变体是如何出现的
通常每个人是其单亲病毒的近乎精确的复制品。 但还经历一个称为重组的过程——它们可以有两个父母。
当两个或多个变体感染个体中的同一细胞时,就会出现重组病毒,从而使变体在复制过程中相互作用。 这可能会导致它们的遗传物质混合,形成新的病毒组合。
有些病毒,例如,具有分段的基因组,并且可以通过称为重配的过程。 病毒重组和重配在病毒中很常见,但发生率差异很大,具体取决于病毒类型和共同感染的机会。
进入两年多以来并且全球感染率很高,与早期阶段相比,重组的可能性更大,也更容易检测到。 全球Omicron浪潮导致新冠病毒流行率迅速上升,这增加了混合感染的机会,并给了病毒更多的重组机会。
我们也比以前更有能力检测重组。 在大流行早期,SARS-CoV-2 病毒几乎没有遗传多样性,重组体看起来很像非重组体,因为两种亲本病毒几乎相同。
但现在有几种基因组不同的变体感染同一地区的人们,使得重组基因组更容易在迄今为止生成的数百万个基因组中被发现。 病毒重组可能在 SARS-CoV-2 的持续进化中发挥重要作用。
已知的病毒重组体
最近发现了几种重组 SARS-CoV-2 变体,命名为 XA、XB、XC 等,一直到 XS。 其中一些变体早在 2020 年中期就已完成测序。 有些只被发现过几次,而另一些则有数百个基因组。
现在经常检测到的重组体主要有两种类型:Delta 和 Omicron 的混合物(称为 Deltacron)以及 Omicron 亚变体的混合物。
其中一些重组体正在受到密切关注。 它们包括 XD 和 XF,由来自 Delta 和 BA.1 Omicron 亚变体的遗传物质组成。
XD 首次在法国被发现,含有 BA.1 的刺突蛋白和 Delta 基因组其余部分的混合物。 有人担心它会继承 BA.1 逃避我们免疫防御的能力和 Delta 的高毒力。 迄今为止,XD 似乎并未广泛或迅速传播。
我们应该担心吗?
目前还没有证据表明重组病毒比任何其他变种对公共健康的威胁更大。 但重组体应该受到密切监测,以便我们了解它们是否会导致病毒传播性、疾病严重程度或逃避疫苗诱导的免疫保护的能力发生变化。
此时,无需过度担心XE。 但我们需要继续在全球范围内监测 SARS-CoV-2,以发现新的变异并了解它们可能带来的风险。
我们限制新重组体或其他变体出现的速度的最佳方法是限制病毒的传播。 尽管世界各地普遍认为 SARS-CoV-2 将成为在可预见的未来与我们一起,我们仍然可以采取防护措施来减缓和抑制病毒。
这些措施包括定期检测、感染时进行隔离、佩戴优质口罩和改善通风。 所有这些措施都减少了同时感染和成为新重组体宿主的机会。
杰玛·吉根,ESR 高级讲师和副科学家,奥塔哥大学;大卫韦尔奇, 高级讲师,奥克兰大学, 和乔普·德里赫特,科学领先基因组学和生物信息学,血沉。